множества факторов, включая расположение генов на хромосоме, их степень гомологии, наличие регуляторных элементов в их окрестностях, а также влияние генетических мутаций и эпигенетических процессов. Например, если два гена находятся близко друг к другу на одной хромосоме, то вероятность их нарушения сцепления будет ниже, чем если бы они находились на разных хромосомах. Также важную роль играют различные ферменты, участвующие в процессе рекомбинации, и условия окружающей среды, которые могут влиять на частоту сцепления генов.