Протобионты - это гипотетические предшественники современных клеток, которые обладали некоторыми свойствами живых организмов, но не обладали строго определенной структурой и функцией клетки. Протобионты могли образовывать липидные везикулы, способные к самовоспроизведению и обмену веществ.

Прокариоты - это одна из двух больших групп живых организмов, которая включает бактерии и археи. Они обладают прокариотной клеточной организацией, то есть отсутствием ядерной оболочки и других внутриклеточных мембран.

Таким образом, основное отличие между протобионтами и прокариотами заключается в том, что протобионты представляют собой предшественников современных клеток, в то время как прокариоты являются одним из двух основных типов организации жизни на Земле.