Разница в использовании артикля в этих двух предложениях связана с тем, как их предметы (коробки) определяются.

В первом предложении "It is a box, the box is black", речь идет о конкретной коробке, которая была упомянута ранее или является частью определенного контекста. Поэтому в данном случае используется определенный артикль "the" перед словом "box".

Во втором предложении "I have eight boxes, the boxes are black", упоминаются несколько коробок, именно поэтому используется неопределенный артикль "a" перед словом "box", так как речь идет о неопределенном количестве коробок. Однако перед словом "boxes" во втором предложении стоит определенный артикль "the", так как затем упоминаются конкретные коробки из предыдущего утверждения.