На території материка Африки внутрішні води розподілені на три основні басейни: Середземноморський, Атлантичний і Індійський.

Середземноморський басейн включає річки, що впадають в Середземне море, такі як Ніл, Тигр і Євфрат.

Атлантичний басейн охоплює річки, які впадають в Атлантичний океан, наприклад, Конго, Нігер та Сенегал.

Індійський басейн включає річки, що впадають в Індійський океан, такі як Замбезі, Лимпопо та Ніл (річка).

Крім того, на території Африки є численні водойми, такі як озера Великий Рифт, озеро Чад, озеро Вікторія та інші.