После сооружения водохранилища уровень грунтовых вод может подняться, что приводит к затоплению корневой системы деревьев, и как следствие, к их гибели. Кроме того, изменения в режиме водоснабжения могут вызвать засоление почвы, что также негативно сказывается на росте и здоровье деревьев. Также водохранилища могут изменить микроклимат в окрестностях, что тоже может оказать воздействие на растительный мир.