Река Амур протекает через различные климатические пояса – от умеренного континентального до субарктического. На нижнем течении, в районе Хабаровска и Хабаровского края, климат умеренный муссонный, с холодными зимами и теплыми летами. В верхнем течении, в районе горы Гора Хара-Хара, климат более суровый, с длительными зимами и короткими, прохладными летами. В целом, климат реки Амур изменяется в зависимости от широты и удаленности от моря.