Западные Саяны, как и другие природные регионы, сталкиваются с рядом экологических проблем, влияющих на биоразнообразие и чистоту окружающей среды. Вот некоторые из них:

Отсечение лесов: вырубка лесов для добычи древесины, добычи полезных ископаемых и под строительство приводит к утрате природных местообитаний для животных и растений.

Загрязнение водных ресурсов: использование химических удобрений, токсичных веществ и нефтепродуктов в сельском хозяйстве и промышленности может привести к загрязнению водных ресурсов, что негативно сказывается на животном и растительном мире.

Браконьерство и незаконная охота: браконьерство животных для получения мяса, шкур и других ценных ресурсов угрожает вымиранию многих видов фауны Западных Саян.

Изменение климата: изменение климатических условий, вызванное глобальным потеплением, также оказывает негативное воздействие на природу Западных Саян, приводя к высыханию лесов, сокращению площадей ледников и другим последствиям.

Недостаток контроля: недостаточное внимание к экологическим проблемам и отсутствие эффективного контроля и мониторинга со стороны государственных органов способствует усугублению ситуации.

Для решения этих проблем необходимо принятие комплекса мер по охране окружающей среды, проведение образовательной работы с населением, содействие в создании заповедников и заповедных зон, а также строгий контроль за деятельностью предприятий, влияющих на экологию региона.