Структура білкової молекули включає в себе чотири основних рівні структурної організації:

Первинна структура: це послідовність амінокислот, з яких складається білок. Ця структура визначає форму та функцію білка.

Вторинна структура: це регулярні структури, які виникають за участю воднювих зв'язків між амінокислотами. Найпоширенішими формами вторинної структури білка є α-спіраль та β-складання.

Третинна структура: це тривимірна організація білка, яка визначається взаємодією між амінокислотами та найбільш стабільними підструктурами, такими як спіральні звитини та ароматичні взаємодії.

Кватерна структура: це взаємодія між декількома підодиницями білка, що утворює його активну форму. Декілька підодиниць можуть з'єднуватися між собою за допомогою різних типів взаємодій, таких як гідрофобні взаємодії, іонні зв'язки та дисульфідні мости.