Фрагмент строения крахмала:

O
|
O - C - C - C - H
|||||
O - C - C - C - H
| |
O O

В крахмале амилоза состоит из а- (1-4)-гликозидных связей, а амилопектин содержит как а- (1-4)-, так и а-(1-6)-гликозидные связи.

Фрагмент строения гликогена:

O
|
O - C - C - C - H
|||||
O - C - C - C - H
| |
O - C - C - C - H
|||||
O - C - C - C - H
|
O

Отличие строения гликогена от амилопектина заключается в том, что гликоген содержит более короткие ветви с а-(1-6)-гликозидными связями, которые встречаются с большей частотой, чем в амилопектине.