Молекула BeF2 имеет центральный атом бериллий. Геометрическая конфигурация частиц - линейная, так как у бериллия нет несвязывающих электронных пар и два атома фтора располагаются по обе стороны от центрального атома. Молекула BeF2 является неполярной. Формально между центральным атомом и фтором задействованы π-связи, так как бериллий и фтор образуют множественную связь.

Ион [BeF4]2- также имеет центральный атом бериллий. Геометрическая конфигурация частиц - тетраэдрическая, так как у бериллия есть 4 атома фтора и необходимо минимизировать отталкивающие взаимодействия. Ион [BeF4]2- является полярным, так как имеет дипольный момент. Между центральным атомом и фторами задействованы σ-связи.

Механизм образования связей в обоих случаях является донорно-акцепторным, так как бериллий обладает электроными донорными свойствами, а фторы - акцепторными.

Отличие в валентных углах между BeF2 (180 градусов) и [BeF4]2- (109.5 градусов) обусловлено различием в числе связей у центрального атома бериллия и различными конфигурациями орбиталей донорно-акцепторных валентных орбиталей.