Химический элемент и атом - это разные понятия. Химический элемент определяется числом протонов в ядре атома, атом же состоит из ядра и электронной оболочки.

Один и тот же химический элемент может существовать в разных изотопах, у которых разное число нейтронов в ядре, но при этом они все будут иметь одинаковое число протонов, и, следовательно, будут принадлежать к одному и тому же химическому элементу. Таким образом, атомы разных изотопов одного и того же элемента будут иметь разное массовое число, но будут относиться к одному и тому же элементу.

Поэтому химический элемент и атом - это различные концепции, и их нельзя полностью отождествлять друг с другом.