Да, бензольное кольцо фенилаланина влияет на изоэлектрическую точку пептида. Фенилаланин - это ароматическая аминокислота, содержащая бензольное кольцо, которое может быть заряжено в зависимости от рН среды. Поэтому в составлении калькулятора изоэлектрической точки пептидов учитывается также и заряд бензольного кольца фенилаланина.