Проанализируйте роль коферментов и ионов металлов в каталитической активности фермента на примере пируватдегидрогеназного комплекса: как нарушение коферментного состава влияет на метаболизм клетки

10 Окт в 13:33
7 +1
0
Ответы
1

Кратко о комплексе и его роли
Пируватдегидрогеназный комплекс ПДГ,PDCПДГ, PDCПДГ,PDC — крупный мультимерный ферментный комплекс митохондрий, который катализирует необратимое превращение пирувата в ацетил‑КоА и связывает гликолиз с циклом Кребса и окислительным фосфорилированием. Комплекс состоит минимум из трёх ферментных компонентов: E1 пируватдегидрогеназа,каталитическаядекарбоксилизацияпируватдегидрогеназа, каталитическая декарбоксилизацияпируватдегидрогеназа,каталитическаядекарбоксилизация, E2 дихидролипоил−транс‑ацетилаза,переносацетильнойгруппынаКоАдихидролипоил-транс‑ацетилаза, перенос ацетильной группы на КоАдихидролипоилтрансацетилаза,переносацетильнойгруппынаКоА и E3 дихидролипоил‑дегидрогеназа,восстановление/реоксидациялипоамидадихидролипоил‑дегидрогеназа, восстановление/реоксидация липоамидадихидролипоилдегидрогеназа,восстановление/реоксидациялипоамида. Для каждой стадии критически важны коферменты и некоторые ионы металлов.

Роли основных коферментов и ионов пошагаммеханизмапо шагам механизмапошагаммеханизма

Тиаминдифосфат ТПФ,витаминB1ТПФ, витамин B1ТПФ,витаминB1 — E1. Участвует в декарбоксилировании пирувата, стабилизирует карбанионный промежуточный продукт гидроксиэтил‑ТПФгидроксиэтил‑ТПФгидроксиэтилТПФ. Без ТПФ переход не происходит → накопление пирувата.Липоамид липоеваякислота,связансE2лизил‑остаткомлипоевая кислота, связан с E2 лизил‑остаткомлипоеваякислота,связансE2лизилостатком — E2. Принимает гидроксиэтильную группу от ТПФ ввидеацильнойгруппыв виде ацильной группыввидеацильнойгруппы, затем переносит ацильную группу на кофермент A. Липоамид служит «молекулярным маховиком».Коэнзим A КоА,кофермент,производныйпантотеновойкислоты,B5КоА, кофермент, производный пантотеновой кислоты, B5КоА,кофермент,производныйпантотеновойкислоты,B5 — принимает ацильную группу от липоамида и даёт ацетил‑КоА.Флавин FAD,производноерибофлавина,B2FAD, производное рибофлавина, B2FAD,производноерибофлавина,B2 — E3. Принимает электроны от восстановленного дихидролипоамида образуяFADH2образуя FADH2образуяFADH2, затем передаёт их дальше на NAD+.NAD+ никотинамид,витаминB3,ниацинникотинамид, витамин B3, ниацинникотинамид,витаминB3,ниацин — окончательный акцептор электронов от E3, формирует NADH, который идёт в дыхательную цепь.Ионы Mg2+ илиMn2+или Mn2+илиMn2+ — стабилизируют комплексы с ТПФ/пируватом и участвуют в связывании нуклеотидов; необходимы для корректной каталитической геометрии.Ca2+ — не обязательно для катализа, но важен регуляторно: активирует пируват‑дегидрогеназную фосфатазу дефосфорилируетиактивируеткомплексдефосфорилирует и активирует комплексдефосфорилируетиактивируеткомплекс в мышцах во время сокращения.Железо‑с‑серные центры Fe‑SFe‑SFeS не входят непосредственно в классическую каталитическую цепочку E1–E3, однако ферменты биосинтеза липоевой кислоты липойл‑синтетазалипойл‑синтетазалипойлсинтетаза зависят от Fe‑S; дефекты биогенеза Fe‑S косвенно нарушают синтез липоамида.

Как нарушение коферментного состава нарушает каталитическую активность

Отсутствие/дефицит ТПФ тиаминтиаминтиамин → E1 не может декарбоксилировать пируват → резкое падение потока пируват → ацетил‑КоА. Следствие: накопление пирувата и его конверсии в лактат лактат‑ацидозлактат‑ацидозлактатацидоз и аланин.Недостаток липоевой кислоты или нарушение её присоединения к E2 генетическиедефектылипойл‑синтетазыилибиогенезаFe‑Sгенетические дефекты липойл‑синтетазы или биогенеза Fe‑SгенетическиедефектылипойлсинтетазыилибиогенезаFeS → E2 не переносит ацильную группу на КоА → блок в передаче ацетила → снижение ацетил‑КоА.Дефицит КоА пантотеноваякислотапантотеновая кислотапантотеноваякислота → у E2 нет акцептора ацильной группы → нет ацетил‑КоА.Нарушение FAD дефицитрибофлавинадефицит рибофлавинадефицитрибофлавина или NAD+ дефицитниацина/снижениеокисленногоNAD+дефицит ниацина/снижение окисленного NAD+дефицитниацина/снижениеокисленногоNAD+ → E3 не может окислить ди‑дихидролипоамид, цикл передачи электронов разрывается → липоамид остаётся восстановленным, комплекс блокируется.Недостаток Mg2+/нарушение ионного гомеостаза → снижение стабильности ТПФ‑пируватных комплексов, падение активности.Повреждение регуляторных путей например,высокийCa2+—активацияПДГ;дефицитCa2+илидисфункцияфосфатаз/киназнапример, высокий Ca2+ — активация ПДГ; дефицит Ca2+ или дисфункция фосфатаз/киназнапример,высокийCa2+активацияПДГ;дефицитCa2+илидисфункцияфосфатаз/киназ ведёт к неверной фосфорилировке и активности комплекса.

Клеточные и системные метаболические последствия

Снижение поступления ацетил‑КоА в цикл Кребса → уменьшение образования NADH/FADH2 → снижение окислительного фосфорилирования и АТФ → энергетический дефицит, особенно чувствительны нервные и сердечные ткани.Компенсаторное увеличение гликолиза и преобразование пирувата в лактат → лактат‑ацидоз, падение pH, снижение эффективности энергетики.Накопление пирувата → увеличение трансаминирования в аланин повышенныйуровеньаланинавкровиповышенный уровень аланина в кровиповышенныйуровеньаланинавкрови.Нарушение синтеза липидов/холестерина ацетил‑КоА—общийсубстратацетил‑КоА — общий субстратацетилКоАобщийсубстрат и ацетилирования белков/метаболических путей.Изменение соотношения NADH/NAD+ → нарушение редокс‑баланса и других NAD+-зависимых реакций.Хронические/генетические дефекты ПДГ приводят к неврологическим нарушениям, задержке развития, эпилепсии; дефицит тиамина вызывает симпто­мы, схожие с поражением ПДГ втомчислеверникe/Beri‑beriв том числе верникe/Beri‑beriвтомчислеверникe/Beriberi.

Клинические и биохимические примеры

Тиамин дефицит берибери,энцефалопатияВерникеберибери, энцефалопатия Верникеберибери,энцефалопатияВернике — сниженная активность ТПФ‑зависимых ферментов ПДГ,α‑кетоглутаратдегидрогеназа,транскетолазаПДГ, α‑кетоглутаратдегидрогеназа, транскетолазаПДГ,αкетоглутаратдегидрогеназа,транскетолаза → метаболические и неврологические нарушения.Наследственная PDC‑дефицитность мутациивE1α,E2ипр.мутации в E1α, E2 и пр.мутациивE1α,E2ипр. — врождённая лактатная ацидозность, неврологическая патология.Нарушения биосинтеза липоата или Fe‑S‑кластеров напр.,принекоторыхмитохондриальныхболезняхнапр., при некоторых митохондриальных болезняхнапр.,принекоторыхмитохондриальныхболезнях → вторичное снижение PDC‑активности.

Итог ключевыевыводыключевые выводыключевыевыводы

Коферменты ТПФ,липоамид,КоА,FAD,NAD+ТПФ, липоамид, КоА, FAD, NAD+ТПФ,липоамид,КоА,FAD,NAD+ выполняют конкретные химические функции на каждом этапе катализа ПДГ; ионы металлов Mg2+,Ca2+Mg2+, Ca2+Mg2+,Ca2+ обеспечивают структурную стабильность и регуляцию.Утрата любого из необходимых коферментов или нарушение их регуляции приводит к «узкому месту» в передаче электроно/ацильных групп и вызывает срыв энергетического обмена, накопление промежуточных метаболитов пируват,лактат,аланинпируват, лактат, аланинпируват,лактат,аланин и серьёзные клеточные/системные последствия.Клинически это проявляется лактатным ацидозом, энергетическим дефицитом тканей с высокой потребностью в энергии и неврологической симптоматикой; причины могут быть как нутритивными витаминныедефицитывитаминные дефицитывитаминныедефициты, так и генетическими/митохондриальными.

Если нужно, могу привести более детальную схему механизма с указанием каждой химической стадии и точных ролей ионов Mg2+,Mn2+Mg2+, Mn2+Mg2+,Mn2+, или описать конкретные клинические случаи и лабораторные находки при дефицитах уровнилактата/аланина,результатыферментныхтестовуровни лактата/аланина, результаты ферментных тестовуровнилактата/аланина,результатыферментныхтестов.

10 Окт в 14:29
Не можешь разобраться в этой теме?
Обратись за помощью к экспертам
Гарантированные бесплатные доработки в течение 1 года
Быстрое выполнение от 2 часов
Проверка работы на плагиат
Поможем написать учебную работу
Прямой эфир