Вода (H2O) - самое известное вещество, содержащее водород. Вода является одним из основных компонентов биосферы и находится повсеместно на Земле.

Газообразный водород (H2) - содержится в атмосфере Земли, хотя его концентрация очень низкая. Водород также может быть найден в более крупных количествах в некоторых планетных атмосферах.

Углеводороды - многие органические соединения содержат в себе водород, такие как метан (CH4), этан (C2H6), пропан (C3H8) и многое другое. Углеводороды широко распространены в природе, включая нефть, природный газ и биомассу.

Водородная сера (H2S) - существует в природе в виде безцветного газа и имеет характерный запах гниющих яиц. Образуется в результате разложения органической материи и можно найти в водных бассейнах, нефтяных месторождениях и вулканических регионах.

Аммиак (NH3) - химическое соединение, содержащее водород, которое широко распространено в природе. Аммиак используется в сельском хозяйстве как удобрение, и его можно найти в почве, воде и атмосфере.