На самом деле, причина этого наименования более сложная. В начале 20 века, территория нынешнего Казахстана и Киргизии была объединена в общее административное образование - Туркестанскую губернию. После революции 1917 года, власти Советской России реорганизовали эту территорию, разделив ее на несколько автономных Советских Социалистических Республик, включая Киргизскую АССР.

В середине 1920-х годов, автономия казахов также была установлена и им было предоставлено административное образование - Киргизскую АССР. Однако, в 1936 году она была переименована в Казахскую ССР и стала называться так до развала Советского Союза.

Таким образом, название КИРГИЗской АССР не имело ничего общего с неверным отождествлением казахов и киргизов со стороны россиян, а являлось результатом исторического и административного развития региона.