Макарий опубликовал своё «Руководство к изучению Православного догматического богословия», ставшее учебником догматики в духовных семинариях после передачи в Святейший Синод. Также он написал своеобразную «энциклопедию богословских наук» — «Введение в Православное богословие».

Митрополит Макарий развивал собственное учение. Одна из основных мыслей его догматики: если бы люди вникали в догматы, то в умы христиан вошло бы многое из того, что говорят проповедники с церковной кафедры. Догмат для Макария — это жизненная истина. В своём труде «Догматика» он говорил о том, что догматы не должны быть предметом одного теоретического знания. Макарий считал: нужно смотреть, что значат догматы и какие требования они предъявляют в практической жизни христиан.