По ситуации. В бою- скорее всего, выжил бы самурай (их с детства учили и фехтовать на мечах, и стрелять из лука), а ниндзя- это просто крестьянин, который изначально оборонял свой дом от самураев-грабителей (так называемых ронинов). А вот при внезапном покушении ниндзя смог-бы победить самурая. Козырь самурая-подготовка, козырь ниндзя-хитрость и внезапность (вплоть до того, что среди ниндзя были и женщины, которые могли убить "объект" путем банального отравления). А вообще сравнивать самурая и ниндзя не корректно. Самурай- воин,офицер; а ниндзя- шпион и диверсант.