В России организации, упомянутые в вашем вопросе, были созданы в разные исторические периоды, и среди них не все были основаны Петром I.

Сенат – действительно был создан Петром I в 1711 году.Святейший Синод – также был учреждён Петром I в 1721 году.Экспедиция о государственных доходах – была создана в 1719 году Петром I.Берг-коллегия – была основана в 1719 году во времена правления Петра I.

Таким образом, все перечисленные органы власти были созданы при Петре I. Следовательно, правильный ответ будет "все".

Если рассматривать вопрос в более широком контексте и искать органы, которые не относятся к правлению Петра I, тогда можно уточнить, что все из приведённых являются его инициативами.