Цели руководителя контр-реформации были связаны с подавлением распространения протестантизма и укреплением позиции католической церкви. Средства, которые использовались для достижения этих целей, включали в себя инквизицию, церковные суды, демонстрации силы и преследования тех, кто отклонялся от установленных догм и учений церкви.

С позиции человека 21 века можно осудить эти средства как нарушение прав человека на свободу вероисповедания, насилие и преследование за религиозные убеждения. Такие методы категорически не допустимы в современном обществе, которое стремится к толерантности, уважению и защите прав каждого человека.

С позиции верующего католика 16 века действия руководителя контр-реформации могут быть оправданы как средства защиты и укрепления веры в истинные учения церкви. В то время католическая церковь сталкивалась с серьезной угрозой со стороны протестантов, и ей приходилось принимать решительные меры для сохранения своего влияния и авторитета. Поэтому верующий католик мог бы считать эти средства оправданными в защите своей религии и веры.