Проблемой, над которой задумывается читатель в романе А. Беляева "Человек-амфибия", является взаимоотношение человека и природы, вопрос сохранения баланса между технологическим прогрессом и окружающей средой, а также идентичность и ценности человечества в условиях быстрого развития технологий и изменения природы.