Чичиков называет Коробочку сначала "крепколобой", потому что это описание отражает его внешность - сильный, крепкий человек. Затем он называет его "дубинноголовой", чтобы подчеркнуть его тупость и ограниченность ума. Это может быть упреком или просто шуткой, сделанной в ходе разговора.