Основная идея книги "Чудесный доктор" Куприна заключается в том, что человек может обрести счастье и спасение благодаря своей вере, доброте и внутренней силе. Главный герой, молодой медик Федот Аркадьич, сталкивается с невероятными испытаниями и трудностями, но благодаря своей вере и человечности он способен преодолеть все препятствия и найти свое призвание в жизни. Книга также обращается к теме чудес и сакрального в мире, показывая, что доброта и вера могут сотворить настоящие чудеса и изменить жизни людей к лучшему.