В повести "Станционный смотритель" нравственные проблемы ставятся через противостояние добра и зла. Конфликт решается через принятие добрых поступков и проявление сострадания со стороны героев.

Персонажи повести совершают недобрые поступки в результате своих эгоистичных и жадных мотивов. Например, Минский стремится обрести материальное благополучие за счет других людей, Дуня и Самсон Вырин также проявляют алчность и жестокость в своем поведении.

Нельзя назвать кого-либо из главных участников конфликта злым человеком в классическом смысле. Однако, их поступки и стремление к личной выгоде находятся в противоречии с принципами морали и сострадания. Особенно неоправданным в их поведении кажется жестокость и равнодушие к страданиям других людей, а также неспособность понимать собственные ошибки и искать примирения.