Комичность фразы заключается в том, что она претендует на понимание исторических процессов как чего-то естественного и линейного, в то время как на самом деле переход от Средних веков к Новой истории был сложным и длительным процессом, связанным с множеством перемен и противоречий. Поэтому утверждение о переходе "постепенно и незаметно" звучит нелепо и вызывает улыбку.