Да, Дуня поняла свою вину перед отцом в конце произведения "Станционный смотритель" Чехова. В последних главах она осознала все свои ошибки и беспокойства, вызванные своим безрассудством и противоречивыми поступками. Она признала свою ответственность за свои поступки и отношения с отцом.