Для того чтобы пользователь www-data имел доступ к сертификату Cryptopro, вы можете изменить права доступа к файлу сертификата, чтобы пользователь www-data мог его прочитывать. Для этого выполните следующую команду:

sudo chown www-data:www-data /путь/к/файлу/сертификата.crt
sudo chmod 644 /путь/к/файлу/сертификата.crt

Таким образом, вы назначите пользователю www-data права на чтение сертификата. Помимо этого, убедитесь, что пользователь www-data имеет доступ к другим необходимым файлам и директориям, например, к ключам шифрования и т.д.

Если вы не хотите изменять права доступа к файлу сертификата, также можно изменить пользователя www-data для nginx и php-fpm. Для этого в конфигурационных файлах Nginx и php-fpm укажите пользователя www-data:

# Для Nginx
user www-data;
# Для php-fpm
user = www-data
group = www-data

После внесения изменений в конфигурационные файлы перезапустите сервисы Nginx и php-fpm:

sudo systemctl restart nginx
sudo systemctl restart php7.4-fpm

Теперь пользователь www-data будет иметь доступ к сертификату Cryptopro и другим необходимым ресурсам для работы с ним.