В предложениях «Только он пришёл» и «Он только пришёл» слово «только» выполняет разные синтаксические роли и изменяет смысл высказывания в зависимости от своего положения.

«Только он пришёл»:

В данном предложении «только» выступает в роли ограничительного слова, указывающего на исключительность. Оно подчеркивает, что среди других, кто мог прийти, пришёл именно он. Смысл выражения заключается в том, что никто другой не пришёл, только он. Интонация при этом может быть настойчивой, акцентируя внимание на слове «только», чтобы выделить это исключение.

«Он только пришёл»:

В этом случае слово «только» также имеет ограничительное значение, но акцентируется на действии, а не на субъекте. Оно подчеркивает, что он пришёл не ранее (т.е. только сейчас) или что ничего больше не произошло, кроме его прихода. Смысл выражения акцентирует момент прихода, возможно, подразумевая, что до этого он находился в каком-то другом состоянии (например, не был здесь, не делал чего-то и т.д.). Интонация здесь может быть более нейтральной, с акцентом на слово «только», указывая на момент времени.

Таким образом, основное отличие между предложениями заключается в том, на что именно направлено ограничение: в первом случае — на субъекта (кто пришёл), а во втором — на действие (что произошло).