Ошибка — в пунктуации и $возможном$ логическом несоответствии. Правильно: «Не согласившись с решением, комиссия ушла.» $нужназапятаяпоследеепричастногооборота$.

Правило:

Деепричастный оборот $деепричастиесзависимымисловами$ выделяется запятыми и обозначает добавочное действие, сопутствующее действию сказуемого. Важное условие: деепричастный оборот должен относиться к подлежащему главного предложения — т.е. к тому же лицу/предмету, что и глагол сказуемого. Если это не так, получается «висячее» $или«отвисшее»$ деепричастие, дающее нелогичное или смехотворное значение.

Примеры висячего деепричастия и исправления:

Неправильно: «Не предупредив начальника, отчёт остался незавершён.» $Ктонепредупредил?$
Исправления: «Не предупредив начальника, сотрудники оставили отчёт незавершённым.» или «Отчёт остался незавершён, потому что не предупредили начальника.»Неправильно: «Прочитав инструкцию, оборудование было настроено неправильно.»
Исправления: «Прочитав инструкцию, инженер настроил оборудование неправильно.» или «Оборудование было настроено неправильно, хотя инструкцию прочли.»

Как избежать висячего деепричастия:

Убедиться, что деепричастный оборот относится к подлежащему; при необходимости изменить подлежащее $чтобыоносоответствовалодеепричастию$. Переписать предложение с придаточным: «потому что», «когда», «так как» и т. п. Заменить деепричастный оборот на причастный оборот или другое конструктивное решение.

Итого: в вашем предложении достаточно поставить запятую: «Не согласившись с решением, комиссия ушла.» Если же подразумевалось, что несогласные были отдельные люди, лучше указать их: «Не согласившись с решением, члены комиссии ушли.»