Правильно: «Он сказал, что придёт позже.»
Пояснение:
- Это сложноподчинённое предложение (главное: «Он сказал», придаточное изъяснительное: «что придёт позже»).
- Придаточное предложение, вводимое союзом «что», отделяется от главного запятой — поэтому ставится запятая перед «что».
- Запятая не ставится внутри союза или между «что» и его придаточным: «Он сказал, что придёт позже.»
- Если передаётся прямая речь, используется двоеточие и кавычки: «Он сказал: “Приду позже.”»