Оба варианта являются приемлемыми и правильными. Вы можете использовать любое из них, в зависимости от вашего обычного языкового оборота или предпочтений. Например, "вода из крана" более официальный и формальный вариант, в то время как "вода из-под крана" может звучать более разговорным и дружелюбным.