Приставка "при-" в словах "прилет" и "приходит" обозначает направление действия к цели или объекту. В данном случае, слово "прилет" означает прибытие в какое-то место (лететь куда-то), а слово "приходит" означает прибытие к кому-то или в какое-то место (идти куда-то).