Да, с течением времени род имен существительных может измениться. Например, слово "кофе" в русском языке изначально имело женский род (как "чашка кофе"), но в последние десятилетия стало употребляться как мужской (как "выпить кофе"). Такие изменения могут происходить под влиянием языковой практики и моды.