Сравнение генов и белков современных организмов с генами и белками их предков. Путем анализа генетического материала организмов и сравнения его с генетическими последовательностями их предков, можно выявить изменения и эволюционные события, которые привели к появлению современных организмов.

Исследование древности генов и белков. Анализ геномов позволяет оценить возраст генов и белков, что в свою очередь может указать на историю эволюции организмов и их отношения друг к другу.

Отслеживание происхождения конкретных генов и белков. При помощи анализа генов и белков можно идентифицировать и отследить происхождение конкретных генов и белков, их мутации и специализацию.

Реконструкция филогенетических деревьев. Путем сравнения генетических данных различных организмов можно построить филогенетические деревья, которые отображают происхождение и эволюцию различных видов.

Определение геномных сходств и различий. Анализ генов и белков современных организмов позволяет выявить общие черты и различия в геномах, что может быть ключом к пониманию происхождения и разнообразия жизни на Земле.