У млекопитающих зачастую имеется сложная система пищеварения с различными органами, такими как желудок, кишечник, печень и поджелудочная железа. У пресмыкающихся система пищеварения более простая, обычно состоящая из одного желудка и кишечника.

Млекопитающие имеют молочные железы для кормления детенышей молоком, в то время как у пресмыкающихся такого нет.

У млекопитающих часто имеется зубная система с различными типами зубов (например, резцы, клыки, жевательные зубы), что позволяет им принимать разнообразную пищу. У пресмыкающихся зубы обычно однотипные и предназначены для захвата и разделения пищи.

Отходы у млекопитающих обычно выходят в виде кала, а у пресмыкающихся – в виде мочи, образующейся в почках.

Эти различия в строении и функциях пищеварительных систем связаны с различными типами питания и адаптацией к окружающей среде у этих двух классов животных.