Для получения антибиотиков часто используют различные виды грибов, такие как Penicillium chrysogenum, Streptomyces griseus, Streptomyces erythreus и другие. Например, пенициллины, первые антибиотики, были получены из Penicillium chrysogenum. Streptomycin, другой известный антибиотик, был получен из Streptomyces griseus. В настоящее время многие антибиотики производятся с использованием микроорганизмов или их ферментов.