Причина заключается во взаимодействии молекул стекла пробки и стеклянного флакона. Поскольку стекло является аморфным материалом, его поверхность не идеально гладкая, а имеет неровности и микроскопические выступы. Поэтому, когда притёртая стеклянная пробка вставляется в горлышко стеклянного флакона, молекулы стекла пробки активно взаимодействуют с молекулами стекла флакона.

Это взаимодействие создает силу сцепления между пробкой и флаконом, что делает трудным вытягивание пробки из корлышка. Кроме того, при долгом хранении стеклянной пробки в флаконе может произойти небольшое уплотнение или изменение формы пробки под действием окружающей среды, что также увеличивает ее трудность извлечения.

Таким образом, хорошо притёртая стеклянная пробка трудно вытягивается из корлышка стеклянного флакона из-за силы сцепления между молекулами стекла пробки и флакона, а также возможного уплотнения пробки в процессе хранения.