Так, в різних молекулах може бути однакова кількість атомів. Наприклад, у молекулі води (H2O) є два атоми водню і один атом кисню, а у молекулі перекису водню (H2O2) також є два атоми водню і один атом кисню.

Аналогія з абеткою може бути такою: у словах "кіт" та "тік" є три букви, але порядок їх розташування відрізняється. Так само із молекулами - вони можуть мати однакову кількість атомів, але різний склад і структуру.