Для данного случая, "тело двигалось равнозамедленно с ускорением a" означает, что ускорение объекта равно по величине, но имеет противоположное направление его движению.

Правильным уравнением в данном случае будет:
S = V0t - (a * t^2) / 2

Таким образом, формула 2 является правильным вариантом в данном случае.