Доказательство существования молекул с помощью рентгеновской дифракции, которое позволяет наблюдать кристаллическую структуру молекул.

Доказательство существования молекул с помощью спектроскопии, которая позволяет анализировать спектры поглощения и испускания света молекул.

Доказательство существования молекул с помощью методов химического анализа, таких как масс-спектрометрия и ядерное магнитное резонансное исследование.

Наблюдение химических реакций, которые происходят именно на молекулярном уровне, также является доказательством существования молекул.