Борьба с распространением сорняков и вредителей может повлечь за собой экологическую проблему из-за использования химических пестицидов и гербицидов. Эти вещества могут загрязнять почву, воду и воздух, уничтожать полезные организмы, такие как пчелы и другие поллинизаторы, а также способствовать развитию суперпаразитов и суперсорняков, которые становятся устойчивыми к химическим препаратам.

Более экологически безопасные методы контроля сорняков и вредителей, такие как биологический контроль, использование натуральных препаратов и методов, основанных на экосистеме, могут быть более предпочтительными с точки зрения сохранения окружающей среды.