Причина различия в солености воды озера Балхаш в восточной и западной частях заключается в том, что озеро является полусолёным. Восточная часть озера Балхаш получает воду из реки Или и других притоков, которая содержит большое количество минералов и солей, что делает воду восточной части озера солёной. В то время как западная часть озера не имеет таких крупных притоков с солёной водой, поэтому вода в западной части озера остаётся пресной.