Католическая церковь вела борьбу с протестантами в течение многих веков, начиная с XVI века, когда началась Реформация. Период этой борьбы часто называется Контрреформацией.

Церковь использовала различные методы для борьбы с протестантами, включая религиозные диспуты, инквизицию, запрет на книги и печатные материалы, проведение контрреформационных соборов, учение против протестантизма (например, концепцию абсолютной верности), а также организацию контрреформационных организаций и обществ, например, Общества Иисуса (иезуитов).

Контрреформация привела к началу бессмысленных войн и конфликтов между католиками и протестантами в различных странах Европы. Однако со временем многие страны нашли компромиссы в религиозных делах и пришли к соглашениям, которые позволили сосуществовать католикам и протестантам.