Вероятно, из сочетания нескольких мотивов:

Личная любовь и новая цель. Встреча с Машей меняет приоритеты Дубровского: месть и «разбойничья» жизнь уже не единственная мотивация, он стремится к отношению с ней, а это требует других поступков и решений. Желание не втягивать крестьян в свою личную драму. Дубровский не прагматичный вождь социального движения, он боится подвергнуть людей репрессиям и расправе ради своей мести, поэтому отходит, чтобы снять с них ответственность и опасность. Тактические и эмоциональные причины: разочарование в праве и обществе, уязвимость, необходимость скрыться или сменить образ жизни — всё это могло подтолкнуть к уходу от «хозяйства» крестьян и отрыв от прежней роли. Наконец, художественная причина: повесть Пушкина незавершённа, финал остаётся открытым, поэтому точный мотив читателю приходится добирать сам на основе намёков автора.

Итого: наиболее правдоподобно — сочетание любви/личных перемен и желания защитить крестьян от последствий его мести, дополненное авторской недосказанностью.