Нет одного общепринятого «самого сложного» вопроса — сложность зависит от области $философия,физика,математика,этика$ и от того, что считать «сложным» $концептуальнонепостижимым,техническинерешённым,эмпирическинедоступным$. Ниже — несколько кандидатов с короткими пояснениями:

«Почему вообще что‑то существует, а не ничто?» — ультимативный онтологический вопрос: требует объяснения первопричины бытия и сталкивается с пределами причинных объяснений. «В чём природа сознания?» $такназываемая«труднаяпроблемасознания»$ — как и почему субъективные переживания возникают из физики мозга; возможно требует новых концепций. «Есть ли свободная воля?» — сочетает философские, нейронаучные и этические последствия; трудно из‑за противоречивых данных и разных определений. «Как объединить общую теорию относительности и квантовую механику?» — фундаментальная задача физики: квантовая гравитация, теория всего; ограничено экспериментами и новыми идеями. «Что такое тёмная материя и тёмная энергия?» — эмпирически обнаруженные феномены без пока убедительного объяснения. Математические «мillennium»‑проблемы $PvsNP,ГипотезаРимана,уравненияНавье–Стоксаидр.$ — формальные вопросы, технически чрезвычайно трудные, но в принципе решаемые. «Что такое справедливость/добро/этика?» — сложен из‑за ценностного разнообразия, культурных различий и практических конфликтов. «Как построить устойчивое, мирное и справедливое общество для всех?» — прикладная, междисциплинарная задача с огромным числом переменных и конфликтующих интересов.

Если хотите, могу:

подробнее разобрать один из этих вопросов $например,«труднуюпроблемусознания»илиPvsNP$, предложить аргументы «за» и «против» разных ответов, или назвать ещё примеры «самых трудных» вопросов в конкретной области. Какой из них вам интересен?