Запятая нужна, если сочетание выступает в качестве составного союза и стоит на стыке частей сложного предложения.

Как только растаял снег, в нашем саду показались первые ростки весенней травы.

Обособление не требуется в случаях, когда «как только» — это сочетание местоименного наречия и частицы.

И как только ты умудрился так сильно испачкаться?