Буква "а" пишется в слове "обнажились" потому что она стояла на том месте в исходном слове - "нагие". Существует такое явление как апофония, при котором в русском языке гласный звук в корне слова может меняться в зависимости от формы слова или окончания. В данном случае, в форме множественного числа произошло изменение гласного "и" на "а".