В русском языке ударение в словах определённых грамматических групп может быть связано с определёнными правилообразующими формами. В случае слова «настроить» и его форм, ударение действительно падает на второй слог $настрОить,настрОила,настрОилит.д.$. Это связано с тем, что глаголы с приставкой «на-» в инфинитиве часто имеют ударение на окончание или на предпоследний слог в различных формах.

Правило, которое подтверждает это ударение, заключается в том, что глаголы с приставкой $например,«на-»,«за-»ит.д.$ в большинстве своём имеют фиксированное ударение на корневой слог. Например, в данном случае глагол «настроить» сохраняет ударение в других формах $настрОить,настрОила,настрОилит.д.$.

Также это можно подтвердить с помощью сравнения с другими глаголами с такой же приставкой и суффиксом. Ударение в них будет находиться в одной и той же позиции, что служит дополнительным подтверждением этого правила.