Правильный вариант — «ввиду отсутствия документа».

Слово «ввиду» является предлогом, который используется для обозначения причины или основания. В данном случае оно указывает на то, что отсутствие документа является причиной путаницы или проблемы.

Форма «в виду» считается устаревшей и менее употребительной, в то время как «ввиду» является современным и правильно оформленным вариантом. Поэтому в вашем случае правильным будет использовать «ввиду отсутствия документа».