Разбор (синтаксис): главная часть — «Папа пришёл» (подлежащее «Папа», сказуемое «пришёл»); придаточное определительное — «который работает врачом» (относится к «Папа», вводится союзным словом «который»).
Два смысла и соответствующая пунктуация:
1) Ограничительное (выделяет, о каком именно отце идёт речь): нет запятых — «Папа который работает врачом пришёл». Значение: из нескольких отцов пришёл тот, кто работает врачом. Интонация без вставной паузы; придаточное тесно связано с определяемым словом.
2) Пояснительное (добавочная информация о уже известном отце): ставим запятые — «Папа, который работает врачом, пришёл». Значение: наш папа (который, кстати, работает врачом) пришёл. Интонационно придаточное обособлено паузами.
Чтобы снять двусмысленность, можно переформулировать:
- Для ограничения: «Пришёл тот папа, который работает врачом.»
- Для пояснения: «Папа, работающий врачом, пришёл.»