Правильный вариант: «Он сказал, что придёт завтра, если погода позволит.»
Пояснения:
- Запятая перед «что» обязательна, потому что далее идёт придаточное изъяснительное, зависимое от слова «сказал» (слово «что» — союз, вводящий это придаточное).
- Запятая перед «если» обязательна, потому что «если погода позволит» — придаточное условное, которое следует за главным (в данном случае — за придаточным изъяснительным «что придёт завтра») и отделяется запятой.
- Запятой между «придёт» и «завтра» не нужно: «завтра» — обстоятельство времени, не отделяется.